結(jié)腸炎應(yīng)與急、慢性腸炎，急、慢性菌痢，非特異性潰瘍性結(jié)腸炎，結(jié)腸癌等相鑒別。最主要的是糞便檢查和乙狀結(jié)腸鏡檢查。還應(yīng)與其他寄生蟲(chóng)引起的腸炎表現(xiàn)相鑒別。如血吸蟲(chóng)病人，可有腹痛腹瀉的癥狀，乙狀鏡檢查可看到腸黏膜上散在有黃色小顆粒，取活組織可查到血吸蟲(chóng)卵。蘭氏賈第鞭毛蟲(chóng)寄生在小腸中，可引起腹痛腹瀉癥狀，大便中可找到該蟲(chóng)的包囊和滋養(yǎng)體，如做十二指腸引流，檢查引流液則陽(yáng)性率更高。過(guò)去多年來(lái)認(rèn)為，寄生在人結(jié)腸中的脆雙核阿米巴是不致病的，但近年來(lái)國(guó)內(nèi)外均有人提出，脆雙核阿米巴可以使某些人出現(xiàn)胃腸道癥狀，以腹痛腹瀉最為多見(jiàn)。大便每天2～4次，呈糊狀，也可成形，結(jié)腸黏膜無(wú)明顯的病理變化。至今未證實(shí)它有包囊，因此感染途徑仍不清楚，有人認(rèn)為可能通過(guò)蟯蟲(chóng)卵或幼蟲(chóng)而感染到人體。此問(wèn)題值得今后進(jìn)一步研究。脆雙核阿米巴滋養(yǎng)體較小，直徑3.5～12µm，鐵蘇木精染色可看到有2個(gè)核，不難與溶組織阿米巴滋養(yǎng)體相區(qū)別。