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[ADA2014]成人隱匿性自身免疫性糖尿病(LADA)家族的全外顯子組測序揭示新的候選基因

摘要:世界衛(wèi)生組織認為,成人隱匿性自身免疫性糖尿?。↙ADA)是1型糖尿病的慢性起病類型,病因是由于自身免疫破壞了胰腺β細胞。然而,LADA也具有一些與2型糖尿病相似的特征。

  世界衛(wèi)生組織認為,成人隱匿性自身免疫性糖尿病(LADA)是1型糖尿病的慢性起病類型,病因是由于自身免疫破壞了胰腺β細胞。然而,LADA也具有一些與2型糖尿病相似的特征,例如成年期發(fā)病、非胰島素依賴以及與2型糖尿病易感基因TCF7L2多態(tài)性高度相關。為進一步闡明LADA與糖尿病其他類型之間的區(qū)別,我們對來自兩個擁有多例LADA患者的家族成員進行全外顯子組測序。

  采用AgilentSureSelectAllExonV4+UTRstargetenrichmentkit來進行外顯子組捕獲。采用NovoAlign進行數(shù)據(jù)比對。采用基因組分析工具(GATK)進行突變體的識別和插入/缺失多態(tài)性(InDel)檢測,方法遵循Broad研究所最佳流程。使用SnpEff軟件進行基因組功能注釋。初步分析排除1型糖尿病以及那些兩個家族所有LADA病例都存在且兩個家族所有非LADA患者沒有的突變體。

  在家族1中,共有3例LADA患者、4例1型糖尿病患者和8例未受累者,主要候選基因為MNX1的內含子突變體。在家族2中,共有2例LADA患者、1例1型糖尿病患者和5例未受累者,主要候選基因為TRPM6的外顯子突變體。TRPM6的外顯子變體導致M333I被取代,據(jù)SIFT算法預測可被破壞。

  以前的文獻已報道過MNX1和TRPM6可能與非自身免疫性糖尿病相關。而且,這些變體未出現(xiàn)于1型糖尿病患者的家族成員中。因此,根據(jù)這些初步觀察結果,我們認為這兩個家族的LADA遺傳學特征更像2型糖尿病而非1型糖尿病。目前正進行進一步的分析以證實這些結果,并鑒別出這兩個家族的其他候選變體。

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