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ADA獎(jiǎng)項(xiàng)啟示糖尿病遺傳學(xué)研究

2014-11-02 來(lái)源:健客網(wǎng)社區(qū)  標(biāo)簽: 掌上醫(yī)生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護(hù)膚
摘要:在體外和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,單基因表達(dá)的調(diào)控可以出現(xiàn)明顯的表型,但是在人群中,基因的個(gè)體差異使得單基因的研究復(fù)雜化,尤其是糖尿病等代謝疾病是多基因疾病,基因型的個(gè)體差異能導(dǎo)致假陽(yáng)性,或掩蓋真實(shí)的與疾病相關(guān)的基因表達(dá)差異。因此,通過(guò)基因組學(xué)的研究能夠鑒別出單基因檢查難以探查到的異常變化。

  美國(guó)糖尿病學(xué)會(huì)(ADA)將2012年度杰出科學(xué)成就獎(jiǎng)授予了DavidAhshuler教授,Ahshuler教授現(xiàn)為哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院和麻省總醫(yī)院的醫(yī)學(xué)及遺傳學(xué)系教授,同時(shí)兼任哈佛大學(xué)和麻省理工學(xué)院的Broad研究中心副主任。他同時(shí)也是多個(gè)基因研究計(jì)劃的倡導(dǎo)者之一,包括單核苷酸多態(tài)性國(guó)際聯(lián)合會(huì)項(xiàng)目(TheSNPConsortium)、國(guó)際人類(lèi)基因組單體型圖計(jì)劃(InternationalHapMapProject)和千人基因組計(jì)劃(1000GenomesProject)等。這些國(guó)際性的研究課題總體宗旨是:更加完整地鑒定出人類(lèi)疾病相關(guān)的基.因多態(tài)性位點(diǎn),從而為基岡變異和疾病的相關(guān)性分析提供完整的數(shù)據(jù)資料;為未來(lái)的基因型測(cè)定平臺(tái)提供更完備的核苷酸多態(tài)性和探針篩選數(shù)據(jù);完善的數(shù)據(jù)庫(kù)能為各國(guó)科學(xué)家提供科研資源,也能用來(lái)更加深入地了解基因突變和重組的過(guò)程和機(jī)制。ADA杰出成就獎(jiǎng)的獲得是對(duì)Altshuler教授在糖尿病和代謝病遺傳學(xué)領(lǐng)域長(zhǎng)期鍥而不舍和卓有成效的研究的肯定,同時(shí),他的研究對(duì)我國(guó)糖尿病工作者也深有啟發(fā)。

  一、Altshuler教授的主要研究領(lǐng)域及成果

  Ahshuler教授及其研究團(tuán)隊(duì)致力于綜合利用人類(lèi)基因組學(xué)、群體遺傳學(xué)、流行病學(xué)研究以及臨床資源來(lái)篩查鑒定疾病的遺傳基礎(chǔ)并以此為依據(jù)開(kāi)發(fā)新的治療手段。他認(rèn)為,目前用于預(yù)防和治療2型糖尿病的方法都只足部分有效,現(xiàn)有的干預(yù)手段并不能完全阻止疾病的發(fā)生,也無(wú)法完全治愈胰島素抵抗。為此,Ahshuler教授的研究團(tuán)隊(duì)基于人類(lèi)基因組的研究來(lái)更廣泛、更深入地尋找決定疾病發(fā)生發(fā)展以及個(gè)體差異的內(nèi)在病理生理機(jī)制和遺傳基礎(chǔ)。通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS),他們成功地鑒定出入類(lèi)基因組內(nèi)有50個(gè)基因區(qū)域能顯著增加代謝病的風(fēng)險(xiǎn)(包括2型糖尿病、心肌梗死和血脂異常),同時(shí)他們還通過(guò)基因測(cè)序技術(shù)來(lái)幫助進(jìn)一步了解不同種族人群的遺傳差異。這些對(duì)于深入了解糖尿病、心血管病以及癌癥的發(fā)病基礎(chǔ)和尋找有效的治療手段具有指導(dǎo)性的意義。

  在鑒定出大約200個(gè)“危險(xiǎn)基因”以后,Ahshuler教授的團(tuán)隊(duì)正在利用下一代基因測(cè)序技術(shù)(next—generationgenomesequencingtechnologies)進(jìn)一步詳細(xì)研究這些風(fēng)險(xiǎn)基因的病理生理功能,最終找出能有效地預(yù)防和治療疾病的目標(biāo)基因。例如,脂肪細(xì)胞分泌的脂聯(lián)素已經(jīng)被證明和2型糖尿病以及相關(guān)的代謝紊亂呈負(fù)相關(guān),脂聯(lián)素水平也同時(shí)受遺傳因素影響。Ahshuler教授及其合作者通過(guò)對(duì)39883個(gè)個(gè)體的GWAS數(shù)據(jù)進(jìn)行薈萃分析,鑒定出8個(gè)與脂聯(lián)素水平相關(guān)的基因位點(diǎn)。繼而通過(guò)對(duì)436個(gè)人體脂肪細(xì)胞樣本中候選區(qū)的mRNA水平對(duì)比分析,在候選區(qū)域鑒定出了18個(gè)候選基因的活動(dòng)與脂聯(lián)素水平相關(guān)。2J。該研究為了解調(diào)節(jié)脂聯(lián)素水平的機(jī)制提供了更加全面的信息。通過(guò)類(lèi)似的研究,Ahshuler團(tuán)隊(duì)及其合作者已經(jīng)鑒定出數(shù)十個(gè)與代谫}疾病和癌癥相關(guān)的基因。

  在體外和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,單基因表達(dá)的調(diào)控可以出現(xiàn)明顯的表型,但是在人群中,基因的個(gè)體差異使得單基因的研究復(fù)雜化,尤其是糖尿病等代謝疾病是多基因疾病,基因型的個(gè)體差異能導(dǎo)致假陽(yáng)性,或掩蓋真實(shí)的與疾病相關(guān)的基因表達(dá)差異。因此,通過(guò)基因組學(xué)的研究能夠鑒別出單基因檢查難以探查到的異常變化。在A(yíng)hshuler教授的一項(xiàng)關(guān)于過(guò)氧化物酶體增殖物活化受體輔助激活網(wǎng)子(PGC)一1Ot和糖尿病關(guān)系的研究中,使用了一種名為基因組富集(genesetenrichmentanalysis,GSEA)的方法,這種分析方法不只查看某一個(gè)基因(如PGC-1d)在疾病中的變化,而是分析一個(gè)基因群組(PGC-1信號(hào)通路里的一組信號(hào)分子)的變化,其優(yōu)勢(shì)在于,基[;!=j群組分析能把單基岡研究無(wú)法鑒別出的差異所導(dǎo)致的下游或上游信號(hào)分子的輕微改變一并分析,鑒別糖尿病患者與正常人的差異。體外實(shí)驗(yàn)已經(jīng)證實(shí)PGC-1【高表達(dá)可以顯著上調(diào)線(xiàn)粒體氧化磷酸化基因的表達(dá),但是糖尿病患者體內(nèi)的PGC—ld活性下調(diào)20%,為了證實(shí)PGC一1活性的下調(diào)能對(duì)患者代謝造成不可忽視的影響,在單基因分析難以得出顯著性差異的情況下,他們通過(guò)使用GSEA對(duì)基因群組分別進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)在糖尿病患者體內(nèi),其中一個(gè)線(xiàn)粒體氧化磷酸化通路的基因組的106個(gè)轉(zhuǎn)錄子巾,有94個(gè)活性均被下調(diào)p1。如果一個(gè)一個(gè)基因來(lái)分析,很可能難以發(fā)現(xiàn)這些基因活性的改變。

  二、對(duì)我國(guó)糖尿病遺傳學(xué)研究的啟示

  我國(guó)在“十一五”計(jì)劃中對(duì)全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)進(jìn)行了優(yōu)先安排,將糖尿病與精神疾病、高血壓、肺癌和食管癌等疾病作為重點(diǎn),對(duì)其遺傳機(jī)制和藥物治療的有效性和安全性進(jìn)行GWAS和藥物基因組學(xué)的系統(tǒng)研究,目前已經(jīng)取得一定的成果,如中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院營(yíng)養(yǎng)科學(xué)研究所研究員、中國(guó)科學(xué)院營(yíng)養(yǎng)與代謝重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任林旭作為國(guó)家“863”計(jì)劃重點(diǎn)項(xiàng)目——“2型糖尿病全基因組關(guān)聯(lián)分析和藥物基因組學(xué)研究”的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人,也在進(jìn)一步開(kāi)展工作。南方基因中心通過(guò)“863”計(jì)劃項(xiàng)目“全基因組關(guān)聯(lián)研究對(duì)照數(shù)據(jù)庫(kù)和驗(yàn)證技術(shù)平臺(tái)”,建立了中國(guó)漢族人群對(duì)照共享樣本庫(kù),同時(shí)賈偉平教授與韓國(guó)、新加坡等聯(lián)合完成了迄今為止樣本量最大的東亞人群2型糖尿病全基因組關(guān)聯(lián)研究,發(fā)現(xiàn)了19個(gè)可能的潛在易感位點(diǎn),并最終確認(rèn)了8個(gè)位點(diǎn)GLIS3、PEPD、FITM2.R3HDML-HNF4A、KCNKl6、MAEA、GCCl-PAX4、PSMD6、ZFAND3。

  我國(guó)GWAS研究已有一定的基礎(chǔ),而Altshuler教授及其團(tuán)隊(duì)對(duì)糖尿病風(fēng)險(xiǎn)基因的GWAS研究,以及ADA對(duì)該研究成果的肯定,進(jìn)一步為我國(guó)糖尿病遺傳學(xué)研究帶來(lái)了一些新的啟示:(1)明確糖尿病的具體發(fā)病機(jī)制。下一步工作應(yīng)該側(cè)重于獲得中圍2型糖尿病人群發(fā)病的相關(guān)位點(diǎn),并對(duì)相關(guān)位點(diǎn)進(jìn)行定點(diǎn)研究,以明確基因變異對(duì)中國(guó)2型糖尿病發(fā)生的具體作用機(jī)制,從而預(yù)測(cè)糖尿病的發(fā)生以及采取一定的措施預(yù)防糖尿病的發(fā)生,進(jìn)一步降低人群中糖尿病的發(fā)病率。(2)提供個(gè)體化治療方案。特定基因攜帶者對(duì)不同藥物的敏感性不同,對(duì)我國(guó)2型糖尿病人群相關(guān)的可能變異位點(diǎn)進(jìn)行GWAS研究,可以破解基因變異對(duì)藥物治療效果的影響,指導(dǎo)2型糖尿病患者的個(gè)體化用藥方案,提高患者對(duì)藥物敏感性。(3)預(yù)防并發(fā)癥的發(fā)生。特定基因在糖尿病并發(fā)癥患者中表達(dá)譜會(huì)有差異,對(duì)2型糖尿病人群相關(guān)位點(diǎn)的GWAS研究,可以明確特定基岡變異與并發(fā)癥的相關(guān)性,從而及早采取措施對(duì)糖尿病并發(fā)癥進(jìn)行干預(yù)。(4)完善糖尿病風(fēng)險(xiǎn)基因譜。中國(guó)幅員遼闊,人口眾多,基因的突變位點(diǎn)也多。且亞美人種與高加索人具有不同的糖尿病風(fēng)險(xiǎn)基因,對(duì)中國(guó)人群巾進(jìn)行GWAS研究,可以進(jìn)一步完善糖尿病風(fēng)險(xiǎn)基因譜。

  基因組的研究既可以廣泛的篩查和疾病相關(guān)的基因位點(diǎn)和基岡型,又可以提供給其他的科學(xué)家用于深入研究的工具和數(shù)據(jù)庫(kù),體外實(shí)驗(yàn)和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)可以進(jìn)一步證實(shí)基因組分析的結(jié)果,而基因組學(xué)的分析手段可以實(shí)現(xiàn)體外和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)無(wú)法完成的多基因分析,將體外實(shí)驗(yàn)和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的證據(jù)與個(gè)體差異相結(jié)合,更加科學(xué)化地應(yīng)用于人類(lèi)疾病的預(yù)防、診斷和治療。

  當(dāng)然,2型糖尿病的發(fā)生中,基因是重要的但不是惟一的影響因素,除了基因以外,還有RNA、蛋白質(zhì)等,除了基因變異以外,還有轉(zhuǎn)錄、翻譯、表觀(guān)、構(gòu)象、調(diào)節(jié)和功能的變化等,因此我們?cè)诶肎WAS技術(shù)對(duì)全基因組進(jìn)行分析的同時(shí),也應(yīng)聯(lián)系其他因素變化對(duì)2型糖尿病發(fā)生的影響,從而為全面分析2型糖尿病的發(fā)病機(jī)制并從根本上防治糖尿病做出中國(guó)人的貢獻(xiàn)。

(實(shí)習(xí)編輯:周家文)

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