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江蘇疾控部門發(fā)現新型環(huán)狀單鏈DNA病毒

2018-07-20 來源:中國病毒學論壇  標簽: 掌上醫(yī)生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯盟 美容護膚
摘要:據介紹,該病毒基因組含2種主要開放讀碼框(ORFs),分別編碼復制酶蛋白Rep和衣殼蛋白Cap;有2個基因間隔區(qū),其中大的間隔區(qū)含有環(huán)狀病毒特征性莖環(huán)結構。

 16日,記者從江蘇省疾控中心獲悉,該中心從一例新加坡回國發(fā)熱病人送檢樣本中,首次鑒定出一種新型環(huán)狀單鏈DNA病毒。

 
根據該中心公布信息:此次新發(fā)現病毒是該中心病原所對今年9月27日江蘇出入境檢驗檢疫局送檢的一例從新加坡回國的發(fā)熱病人咽拭子樣本進行病原體檢測后所得。病原所實驗室人員通過對送檢樣本用高通量測序技術檢測發(fā)現其中含有一種新型環(huán)狀單鏈DNA病毒片段,后根據高通量測序reads序列設計特異引物,對病人咽拭子樣本進行PCR擴增,產物經過sanger測序、序列組裝,于10月26日獲得該病毒全長基因序列3018nt。
 
據介紹,該病毒基因組含2種主要開放讀碼框(ORFs),分別編碼復制酶蛋白Rep和衣殼蛋白Cap;有2個基因間隔區(qū),其中大的間隔區(qū)含有環(huán)狀病毒特征性莖環(huán)結構。與該病毒最相似的為豬糞相關的環(huán)狀病毒5(porcinestool-associatedcircularvirus5(PoSCV5),isolateCP3),編碼蛋白氨基酸序列相似性約為43%和50%,進化分析揭示這2種編碼蛋白分別與環(huán)狀病毒科及未分類的環(huán)狀單鏈DNA病毒聚為一類,疑似為一種新型病毒。
 
目前,該中心初步將該病毒命名為HumanPoSCV5-likecircularvirus(isolateMRJ),基因組序列已遞交GenBank數據庫(Accessionno.KY052047)。
 
根據實驗室分析,在對病人的尿、血和唾液樣本進一步檢測中發(fā)現,唾液中可以檢測出該病毒,而尿和血液中檢測不到。
 
此前發(fā)現的豬糞相關的環(huán)狀病毒可引起豬腹瀉,人未見感染報道。其他種屬的環(huán)狀單鏈DNA病毒有在多發(fā)性硬化癥病人的腦積液和血清、心包炎病人的心包液及腦炎病人的腦積液檢測出的報道,但是與疾病的聯系均不能確立。所以,目前該新型環(huán)狀單鏈DNA病毒與病例所患疾病的關聯還不明確。
 
目前,實驗室正對樣本進行病毒分離培養(yǎng),以便開展下一步的研究工作。
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